Justyna Kubacka

Wykształcenie:

2013 – stopień naukowy doktora nauk biologicznych (dyscyplina: ekologia), Instytut Nauk o Środowisku, Uniwersytet Jagielloński

Zainteresowania badawcze

Moje zainteresowania badawcze obejmują ekologię, ekologię ewolucyjną i ochronę ptaków, a także genomikę konserwatorską. W ostatnich latach moim modelem badawczym jest wodniczka Acrocephalus paludicola, rzadki gatunek ptaka o bardzo ciekawej biologii rozrodu. Wraz ze współpracownikami przyjrzałam się zapasożyceniu krwi u tego gatunku oraz różnorodności genetycznej oszacowanej na podstawie markerów mikrosatelitarnych. Zrealizowałam także badania określające depresję wsobną u wodniczki, a obecnie prowadzę dwa projekty z zakresu genomiki populacyjnej. W przyszłości planuję zbadać, dlaczego u samic ptaków występuje kojarzenie wielopartnerskie – w szczególności u gatunków nietworzących par rozrodczych. Chciałabym także przyjrzeć się zmienności sukcesu reprodukcyjnego u samców i sprawdzić, czy może być wytłumaczona przez obecność alternatywnych strategii rozrodczych.

Granty i projekty

1. 2024-2025 Insights into Aquatic Warbler inbreeding and population genomics using whole-genome sequencing. Finansowanie: Konsorcjum European Reference Genome Atlas – Biodiversity Genomics Europe oraz Swiss Institute of Bioinformatics.
2. 2023-2025 Survival in an extremely fragmented habitat? - Population genetics of the vulnerable Aquatic Warbler Acrocephalus paludicola. Finansowanie: Niemieckie Towarzystwo Ornitologiczne (DO-G).
3. 2016-2019 Depresja wsobna oraz unikanie wsobności u wodniczki Acrocephalus paludicola - gatunku, który przeszedł gwałtowny spadek liczebności: ocena na podstawie markerów SNP uzyskanych drogą sekwencjonowania nowej generacji (RADseq). Finansowanie: Narodowe Centrum Nauki.
4. 2014-2015 Population genetics of the Aquatic Warbler Acrocephalus paludicola in Eastern Poland. Finansowanie: British Ornithologists Union.
5. 2011-2014 Wpływ koszenia na produktywność lęgową wodniczki. Finansowanie: Ogólnopolskie Towarzystwo Ochrony Ptaków.
6. 2010 Effects of immune challenge on the courtship song in the Zebra Finch. Finansowanie: Uniwersytet Jagielloński
7. 2009 Effects of immune challenge on reproductive output in the Great Tit. Finansowanie: Uniwersytet Jagielloński
8. 2006-2008 Wpływ kondycji osobnika oraz warunków środowiska na wybór ryzyka, czyli zmienności zysku podczas żerowania, u sikor żerujących na wolności. Finansowanie: Komitet Badań Naukowych.

Odbyte kursy

2024-2025 Omics Data Science – Bioinformatyka i analiza wielkoskalowych danych biomedycznych, Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Unwiersytetu Warszawskiego
2019 8th Programming for Evolutionary Biology course, Berlin, Niemcy
2018 Workshop on Population and Speciation Genomics, Cesky Krumlov, Czechy
2017 Workshop on Genomics, Cesky Krumlov, Czechy
2016 Introduction to RAD-seq Data Analysis, University of Edinburgh, Wielka Brytania

Wybrane publikacje
1. Kubacka J., Dubiec A., Arantes L.S., Herdegen-Radwan M., Mazzoni C.J., Sparmann S. & Osiejuk T.S. 2025. Agonistic song rate positively correlates with male breeding success and avian malaria infection in Acrocephalus paludicola (Aquatic Warbler), a promiscuous songbird with female-only parental care. Ornithology 142(1):ukae045 https://doi.org/10.1093/ornithology/ukae045 
2. Wołoszkiewicz J., Kubacka J. & Kloskowski J. 2024. Breeding ecology of the globally threatened Aquatic Warbler Acrocephalus paludicola in calcareous fens at the south-western range limit. Bird Cons. Int. 34:e40 https://doi.org/10.1017/S0959270924000352 
3. Kubacka J., Dubiec A., Korb J., Salewski V., Dyrcz A., Foucher J., Giessing B., Leisler B., Schulze-Hagen K., Wink M. & Panagiotopoulou H. 2024. Low genetic diversity and high gene flow in the Aquatic Warbler (Acrocephalus paludicola), a threatened marshland songbird with a fragmented breeding range. Ibis 166: 232-251 https://doi.org/10.1111/ibi.13250 
4. Mc Cartney A.M., Formenti G., Mouton A., (...) Kubacka J., (...) & Mazzoni, C. 2024. The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics. npj Biodiversity 3(1):28 https://doi.org/10.1038/s44185-024-00054-6 
5. Osiejuk T.S. & Kubacka J. 2023. Male song of the Aquatic Warbler, a promiscuous bird without paternal care, is more complex than previously thought. Sci. Rep. 13(1):5714 https://doi.org/10.1038/s41598-023-33001-9 
6. Kubacka J., Podmokła E., Korb J. & Dubiec A. 2020. Heterozygosity and fitness in a threatened songbird: blood parasite infection is explained by single-locus but not genome-wide effects. J. Ornith. 161:803–817 https://doi.org/10.1007/s10336-020-01753-0 
7. Kubacka J. & Cichoń M. 2020. An immune challenge of female great tits decreases offspring survival and has sex-specific effects on offspring body size. Acta Ethol. 23:173–181 https://doi.org/10.1007/s10211-020-00351-w 
8. Kubacka J., Gerlée A., Foucher J., Korb J. & Podmokła E. 2019. Correlates of blood parasitism in a threatened marshland passerine: infection by kinetoplastids of the genus Trypanosoma is related to landscape metrics of habitat edge. Parasitology 146(8):1036-1046 https://doi.org/10.1017/S0031182019000350 
9. Grzędzicka E. & Kubacka J. 2018. Ambient temperature impacts the effect of experimental immunisation of Great Tit and Eurasian Blue Tit females on the PHA response of their offspring. J. Ornith. 159:761–770 https://doi.org/10.1007/s10336-018-1534-3
10. Kubacka J., Oppel S., Dyrcz A., Lachmann L., Da Costa J.P.D.B., Kail U. & Zdunek W. 2014. Effect of mowing on productivity in the endangered Aquatic Warbler Acrocephalus paludicola. Bird Cons. Int. 24(1):45-58 https://doi.org/10.1017/S095927