Unia Europejska

foto Piotr Ślipiński

Automatyczne stacje pipetujące

               

Microlab Star Line (Hamilton Robotics)

Stacjonarna stacja robocza wykorzystująca wyporność powietrza oraz technologię pipetowania CO-RE. Urządzenie kontroluje działania na każdym etapie procedury - od wprowadzenia prób do ich przetworzenia, gwarantując maximum bezpieczeństwa dla każdej z prób. Umożliwia przetworzenie wielu prób w tym samym czasie, zmniejszając osobowe nakłady czasu pracy i błąd pipetowania
do minimum. Ma bardzo szerokie zastosowanie, tj. izolacja, oczyszczanie DNA, nastawianie reakcji PCR, diagnostyka. Urządzenie opatrzone jest oprogramowaniem zapewniającym kontrolę nad przebiegiem procesu laboratoryjnego.

MiIZ PAN posiada dwie stacje Microlab Star Line: do izolacji DNA i nastawiania reakcji PCR (1) i oczyszczania produktów PCR (2).

 

Osoba do kontaktu:       dr Hanna Panagiotopoulou-Stawnicka

                                               This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

                                               22 629 32 21 wew. 156

 

automatycznestacjepipetujace

automatycznestacjepipetujace1

automatycznestacjepipetujace2


             

System MassARRAY

Agena Biosciences (Sequenom)

Dedykowany do wysokoprzepustowej analizy kwasów nukleinowych metodą spektrometrii mas MALDI-TOF (ang. Matrix Assisted Laser Desorption and Ionisation - Time Of Flight). Pozwala rozdzielać oligonukleotydy różniące się masą o 15Da. Aparat może posiadać 4 różne moduły:

  1. moduł Typer do analizy SNP
  2. moduł EpiTyper do metyzacji DNA
  3. moduł QGE do pomiarów ekspresji genów
  4. moduł iSEQ do identyfikacji mikroorganizmów

Instytut posiada pierwszy z nich (Typer). Urządzenie umożliwia multipleksowanie do 40 SNP w jednej próbie.  Wysoka czułość aparatu pozwala analizować mutacje somatyczne,  występujące z  częstością zaledwie 0,1% w 96 próbach jednocześnie. Do przeprowadzenia analizy wystarcza 5 ng DNA.

 

 

spektrometrmasdodna

Osoba do kontaktu:       Prof. dr hab. Tadeusz Malewski

                                              This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

                                               22 629 32 21 wew. 118

 

 


Skaner do mikromacierzy

LS Reloaded (Tecan)

Uniwersalny, konfokalny skaner umożliwiający skanowanie większości mikromacierzy DNA
oraz mikromacierzy białkowych. Skaner wyposażony jest w cztery lasery (635 nm, 532 nm, 488 nm, 594 nm). Rozdzielczość skanowania wynosi od 4 do 40 mkm.

Osoba do kontaktu:       Prof. dr hab. Tadeusz Malewski

                                              This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

                                               22 629 32 21 wew. 118

 

 

skanerdomikromacierzy

Osoba do kontaktu:       Prof. dr hab. Tadeusz Malewski

                                              This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

                                               22 629 32 21 wew. 118

 

 


Image

Image

Image

HITACHI S-3400N Scanning Electron Microscope

Operating in variable-vacuum conditions and equipped with an EDS x-ray microanalyser, this apparatus provides for the observation and both quantitative and qualitative analysis of metal preparations and non-metal ones that conduct electricity, as well as biological samples, and non-conducting materials

Main parameters of the microscope:

  • The microscope can operate:
    • normally (in a high vacuum), with resolution up to 3nm (SE detector) or 4nm(BSE detector),
    • at low voltage (for UACC<5kV, UACC<3kV) – resolution to 10 nm (SE detector),
    • naturally (in a low vacuum) – resolution to 4 nm (BSE detector),
  • acceleration voltage 0.3kV 30kV,
  • table (automatically on five axes),
  • a work chamber of internal diameter 215 mm allows relatively large objects to be observed,
  • magnification 5 – 300,000x,
  • image memory up to 5120x3840 pixels

The microscope is also equipped with:

  • a Pelier-system cooling table,
  • an infra-red CCD cell observation camera.

    Additional equipment:

  • an E3100 critical point drier apparatus to dry biological preparations in a CO2 atmosphere
  • an SC7640-type ion duster to dust samples of metals.

Research work is carried out for both the Museum and Institute of Zoology and other scientific institutes, higher education establishments, industrial partners, and so on.

Those interested in the research opportunities are invited to contact:

Magdalena Kowalewska, D. Eng. 
tel. 022 357-50-01 
022 357-30-01 

e-mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.


Examples:

Image

Image Image  Image
 1DC k_m01 Enicocephalidae F pressilabris samiec
 Image  Image  Image
Kokolit 1 Kokolit 2 Trissonchulus benepapillosus 
 Image Image  Image 
Oko komara Warstwa fosoranowa na AL Trissonchulus benepapillosus 
 Image Image  Image 
 Fragment przewodu pokarmowego ślimaka Ceapea vindobonensis   Fragment przewodu pokarmowego ślimaka Ceapea vindobonensis (obraz SE) 
Ochterus
 Image Image   Image
Fragment skrzydła Borysthenes   Patyczak Warstwa Ni

Jakościowe i ilościowe analizy składu chemicznego w mikroobszarze (EDS) oraz mapping obrazu i linescan
 Image Image 
Opoka - okolice Bychawy  Skorupa ślimaka 
- Helicidae: Cepaea 
 Image Image 
 Skorupa ślimaka 
- Helicidae: Cepaea
Warstwa Ni na warstwie NI-P
(podłoże Cu) 

Blue Pippin

Aparat z grupy Pippin DNA system (Sage Science), służący do elektroforetycznego rozdziału i elucji określonego zakresu długości fragmentów DNA lub cDNA. Usprawnia i optymalizuje procedurę przygotowania bibliotek do sekwencjonowania nowej generacji (NGS), umożliwiając ograniczenie insertów DNA do określonego zakresu długości.

Dostępne są kasety o różnej procentowości żelu agarozowego, co daje dużą elastyczność wyboru zakresów wielkości przygotowywanych bibliotek.

Prosty sposób przygotowywania prób do frakcjonowania i ich odzyskania po elucji, pozwala
na zmniejszenie nakładu pracy związanego z selekcją fragmentów DNA lub cDNA żądanej długości.

 

 

 

precyzyjnaelektroforeza

Osoba do kontaktu:

dr Hanna Panagiotopoulou-Stawnicka

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

22 629 32 21 wew. 156

 

Bioanalyzer (Agilent Technologies)

Urządzenie bazujące na technologii Microfluidics (łączącej elektroforezę mikrokapilarną, mikropłynów, mikroczipów i detekcji fluorescencyjnej), służące do automatycznej elektroforezy kapilarnej DNA lub RNA. Pomiar urządzenia cechuje wysoka powtarzalność.
Do jego wykonania wystarczą niewielkie ilości materiału.

Urządzenie służy do jakościowych i ilościowych analiz DNA lub RNA (w tym określania integralności RNA) jak również do określenia długości poszczególnych frakcji kwasów nukleinowych na podstawie elektroforetogramu.

Bionalyzer polecany jest przez firmę illumina oraz PacBio® do oceny bibliotek przygotowywanych
do sekwencjonowania.

MiIZ PAN poza urządzeniem Bioanalyzer posiada również urządzenia do precyzyjnego pomiaru ilości DNA lub RNA – Quantus™ Fluorometer (Promega) oraz Qubit Fluorometer Quantification (ThermoFisher).

Osoba do kontaktu:

dr Hanna Panagiotopoulou-Stawnicka

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

22 629 32 21 wew. 156

 


Minolta VI - 9i 3D Laser Scanner

This apparatus is capable of transfer ring a three-dimensional image of a given object (of defined parameters – see limitations) to computer memory.

The scanner operates on the principle of laser triangulation in which the object is scanned with the aid of a line of laser light whose course is followed by a digital camera. The curvature of the line on the object under study is used as the basis for building up the three-dimensional image. The camera also reads off the colour of the object, which can be added to the model in the form of texture.

The object for scanning is placed on a special table and read with the laser as the apparatus rotates through a determined number of degrees. The individual scans are then combined together by reference to characteristic points determined by the operator. 



Possibilities


The scanner does not harm the eyes and so may be used to scan human faces. Depending on the size of the object, it is possible to use one of three objectives whose accuracies are as follows:

TELE XYZ: ±0.05mm/ ±0.10mm
MIDDLE XYZ ±0.10mm/ ±0.20mm
WIDE XYZ ±0.20mm/ ±0.40mm



 

Properties of scanned objects - limitations

  • Transparent surfaces or those reflecting laser light must be covered with powder
  • Deep-black surfaces are the ideal background colour for the scanner and must also be made subject to defined processes.
  • Objects of dimensions greater than 1200/900/750 mm have to be scanned in stages.
  • Objects of very complex shapes and sizes over 2 cm must be considered separately.


Sample scans:

 

     
     
     

 

 


 


3D - PDF files to download

 

 

     
 Pelvis bone (10,0 MB)  Skull (6,5 MB)  Pelvis bone (9,2 MB)
     
 Tiba (3,7 MB) Sacral bone (4,3 MB) Vertebra (2,3 MB)